История фильма «Аватар: Путь воды» начинается спустя более 10 лет после событий, показанных в первой части оригинальной картины. Джейк Салли продолжает быть вождём, воспитывая семью, состоящую из его сыновей и дочерей, включая приёмную Кири.
К величайшему ужасу На’ви человечество получает возможность вернуться на тихую и спокойную Пандору, чтобы попытаться колонизировать её. Вскоре здесь появляется оперативная база людей, угрожающая всему живому. Среди прибывших оказывается Куорич, являющийся клоном На’ви и имеющий ряд воспоминаний, загруженных в его мозг. Джейк разворачивается широкую партизанскую кампанию, чтобы дать отпор недавно появившимся здесь людям. Он собирается всё вернуть на прежнее место. А в это время Куорич проводит жестокую миссию по борьбе с повстанцами. Джейк становится его личным врагом. Не сумев убить Джейка, Куорич решает взять в плен его детей. С этого момента события для всех героев фильма «Аватар: Путь воды» разворачиваются самым непредсказуемым способом.